Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf1P15314 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf1P15314 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf1P15314 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms