Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd5P13379 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd5P13379 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms