Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms