Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms