Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ApcsP12246 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ApcsP12246 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms