Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itga5P11688 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itga5P11688 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms