Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms