Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa9P09631 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa9P09631 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms