Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VIL1P09327 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIL1P09327 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms