Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna4P07351 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms