Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tcrg-V1P06325 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms