Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01798 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01798 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01798 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01798 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01798 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01798 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01798 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01798 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms