Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms