Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms