Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms