Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bnc1O35914 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms