Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sp100O35892 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp100O35892 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sp100O35892 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp100O35892 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp100O35892 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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