Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra3O35118 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms