Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn4O35054 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn4O35054 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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