Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SdcbpO08992 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SdcbpO08992 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms