Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MttpO08601 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MttpO08601 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MttpO08601 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MttpO08601 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MttpO08601 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MttpO08601 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MttpO08601 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MttpO08601 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MttpO08601 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms