Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r80L7N1Z3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r80L7N1Z3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms