Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm19965J3QNY8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm19965J3QNY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms