Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AK157302I3ITR1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AK157302I3ITR1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AK157302I3ITR1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms