Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17093F6XGJ4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17093F6XGJ4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms