Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3676D3Z236 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3676D3Z236 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms