Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700018F24RikB2RW27 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms