Protein–RNA interactions for Protein: A2BG94

Gm6890, Predicted gene 6890, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6890A2BG94 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6890A2BG94 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6890A2BG94 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms