Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn34dA2AGU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn34dA2AGU5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn34dA2AGU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn34dA2AGU5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34dA2AGU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms