Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam71e1A1L3C1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms