Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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H2-Eb1P04230 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-Eb1P04230 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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