Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 AC133156.2-201ENSMUST00000226865 784 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Trim35Q8C006 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Gm36752-201ENSMUST00000220527 1546 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Zfp94-202ENSMUST00000108436 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Esrrb-204ENSMUST00000116402 4300 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Trim35Q8C006 Synm-203ENSMUST00000207102 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Trim35Q8C006 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Trim35Q8C006 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Trim35Q8C006 Lypd5-201ENSMUST00000032683 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trim35Q8C006 Pfkp-207ENSMUST00000138703 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 C330018D20Rik-201ENSMUST00000025488 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Hp1bp3-214ENSMUST00000165861 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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