Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Scn3aA2ASI5 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Scn3aA2ASI5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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