Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Snx8Q8CFD4 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms