Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp9xP70398 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms