Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna2d3Q9Z1L5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms