Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Padi1Q9Z185 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Padi1Q9Z185 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms