Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme3Q9WV85 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme3Q9WV85 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms