Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim3Q9R1R2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim3Q9R1R2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim3Q9R1R2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms