Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcl11aQ9QYE3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcl11aQ9QYE3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms