Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms