Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l1Q9D9H3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l1Q9D9H3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms