Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23bQ9D8T4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms