Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slx4ipQ9D7Y9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms