Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb8Q9D6J5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb8Q9D6J5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms