Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc130Q9D516 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms