Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc83Q9D4V3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc83Q9D4V3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms