Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms