Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms