Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rprd1bQ9CSU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms